Le débat porte sur la manière de financer la gestion du réseau Natura 2000, principal outil européen de protection de la nature, un financement évalué, pour la période 2007-2013, à 21 milliards d’euros.

Dans son projet initial, la Commission Européenne souhaitait déléguer la gestion de Natura 2000 aux fonds de développement rural et aux fonds structurels, et la politique de l’environnement aux Etats-membres.

Considérant ce dispositif comme notoirement insuffisant, Marie-Anne Isler-Béguin, députée Verts, veut, au contraire que ces 21 millards soient inscrits dans un projet spécifique bénéficiant de fonds garantis.

Rapporteure pour la Commission Environnement du Parlement Européen, elle avait obtenu de celle-ci, en avril, que le financement des sites Natura 2000 soit inscrit dans LIFE+ (Financial Instrument for the Environment), la nouvelle version de cet "instrument financier" introduit en 1992.

Dans un article publié sur son site, Marie-Anne Isler-Béguin se félicite que, le Parlement européen ait adopté, ce 7/07/05, par 520 voix pour et 52 contre, le rapport de la Commission Environnement. « Ce vote est une victoire pour la biodiversité européenne et confirme la volonté du Parlement de maintenir un niveau élevé de protection environnementale en Europe. Le réseau Natura 2000 en est à ses prémisses. Il ne survivrait pas sans financement adéquat ».

Le débat n’est cependant pas encore terminé. En effet, l’instrument financier LIFE + est soumis à la procédure de codécision. Marie-Anne Isler-Béguin indique que, selon le programme de la Présidence britannique, le Conseil de l’Environnement devrait tenter de proposer un accord politique lors de sa réunion de décembre 2005.